Водород, входящий в состав молекулы воды H2O, является связанным  атомом. 
Молекулярный водород, которым обогащают воду - это самостоятельное вещество. Вода, насыщенная молекулярным водородом - это самый простой способ "доставить" водород в наш организм.

Основная цель водорода в нашем теле - это борьба с оксидантами, из-за которых возникает старение, различные болезни и преждевременная гибель клеток.
Например, гидроксильный радикал (OH, самый опасный для организма) при реакции с водородом превращается в обычную воду и больше не несет никакой угрозы нашему телу:

2(•ОН) + H2 = 2H2O

В этом и заключается главный смысл употребления воды насыщенной молекулярным водородной.